La colección cuenta con más de 2.000 fondos: modelos de barcos de distintas épocas, instrumentos náuticos, retratos, grabados, modelos, uniformes y condecoraciones. Entre las piezas sobresalen un cañón de bronce de 1697, fabricado en Nápoles, y el primer mascarón de proa del buque escuela Juan Sebastián de Elcano.
El museo recorre la historia de la Armada y dedica una especial atención a su vinculación con Cádiz, a través de la Escuela de Suboficiales y de las unidades de Infantería de Marina y del Arma Aérea asentadas en la bahía gaditana.
Con motivo del XX aniversario, el próximo 13 de abril se inaugurará una maqueta de la Población Militar de San Carlos, que será exhibida en la Sala de Banderas del museo.
Financiada por la Fundación Museo Naval, la maqueta se ha elaborado conforme a los planos del Marqués de Ureña, el ingeniero y arquitecto que dirigió las obras de la Población de San Carlos a finales del siglo XVIII. Fue promovida en el año 2009 por el capitán de fragata José Carlos Fernández, presidente de la Asociación isleña As de Guía, y ha sido construida por el maquetista Francisco Reseco Fernández.
http://www.armada.mde.es/ArmadaPortal/page/Portal/ArmadaEspannola/conocenos_noticias/00_noticias/2012/03/NT-052-MNAVAL-SFDO_ES;jsessionid=dgZ0PyTSByJTjp2cMPFfTvPhGLQmrYXtybXQJp1hyzT2fCnyyym5!1590717938?_selectedNodeID=758091&_pageAction=selectItem
